В пещере встречаются позвоночные трех групп: рыбы, летучие мыши и грызуны.
Большая часть имеющейся информации получена неспециалистами и поэтому весьма неточна. Она касается животных, обнаружение которых не требует специальных методов. Лишь в 2002 г. Биологи ПГУ и Института экологии и генетики микроорганизмов Н.Н. и Н.В. Паньковы и Е.Ю.Крайнев, обследуя пещеру в целях изучения фауны в пределах экскурсионного маршрута, применили используемые в гидробиологии специальные методики сбора материала, что принесло хорошие результаты. Найденные беспозвоночные относятся к двум типам: Nemathelminthes (Круглые черви) и Arthropoda (Членистоногие).
Жуки-прицепыши
Мелкие (длина взрослых форм 1,3 - 4,5мм), темноокрашенные насекомые, обитающие в незагрязненных реках и ручьях. Они живут на водных растениях или камнях, по которым передвигаются, цепляясь коготками. В центральной части озера в гроте Дружбы Народов обнаружена молодая (0,6 мм) личинка жука-прицепыша(Riolus cupreus). Личинки и взрослые жуки этого вида обычны в р. Сылве. Очевидно, найденная в пещере особь занесена сюда полыми водами.Встречающиеся в пещере плесени и грибы относятся к трем группам настоящих грибов: гифомицеты, зигомицеты и базидиомицеты.
В Кунгурской Ледяной пещере зеленые растения встречаются только возле прожекторов. В гроте Длинный, В проходе между гротами Метеорный и Коралловый произрастают небольшие популяции мха Pohlia wachlenberi (определение А. Безгодова). По данным Е.П. Дорофеева, в 1980-е годы в озере грота Атлантида у подводного прожектора активно росли зеленые нитчатые водоросли.